15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2487 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  63.75 
 
 		 159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  58.75 
 
 		 160 aa  191  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  67.77 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  65.38 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  64.52 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  64.75 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  49.57 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  42.4 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  40.83 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  23.97 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>