47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1830 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  70.59 
 
 
120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  69.42 
 
 
121 aa  173  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  35.59 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  28.81 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  29.17 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3852  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000776129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  31.53 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  34.23 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  25.64 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0568  hypothetical protein  37.23 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000883944  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  26.85 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  32.43 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  34.23 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  28.7 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  33.64 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  33.03 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  33.67 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  29.73 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  29.52 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  30.08 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  22.69 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  31.43 
 
 
271 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  31.43 
 
 
271 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  28.1 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  30.48 
 
 
271 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  25.62 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  26.89 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  26.83 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  28.57 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  28.85 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  26.05 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  29.41 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  27.19 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  30.21 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  25.62 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  25.62 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  31.4 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  30.23 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  29.2 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  28.43 
 
 
114 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  28.4 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  29.55 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  22.22 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>