92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1365 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  94.74 
 
 		 114 aa  221  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  92.11 
 
 		 114 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  71.05 
 
 		 114 aa  179  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  71.93 
 
 		 114 aa  174  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  41.03 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4238  DsrE family protein  39.82 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.7809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  36.21 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3261  DsrE family protein  37.61 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3843  DsrE family protein  37.07 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3936  DsrE-like protein  34.48 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  32.48 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  33.62 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  37.17 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  34.17 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  32.76 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  30.83 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  31.15 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  34.75 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  34.75 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  34.75 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  34.75 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  29.2 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  31.97 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  31.97 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  31.97 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  33.05 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  31.71 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  31.71 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  33.9 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  31.71 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  31.71 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  31.03 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  28.32 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  30.89 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  31.62 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  31.62 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1129  DsrE family protein  31.62 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000155776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  31.62 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  29.63 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2206  DsrE family protein  32.2 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  32.41 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  30.51 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0963  DsrE family protein  26.72 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1760  DsrE family protein  26.72 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000400151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1814  DsrE family protein  26.72 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000375732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1103  DsrE family protein  28.81 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.520397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  30.83 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  31.03 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000786463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  35 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0167  DsrE family protein  34 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0541561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  29.57 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4455  DsrE family protein  31.3 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  29.17 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  32.76 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.77 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  29.82 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  29.17 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  31.67 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3985  iron-sulfur binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1894  DsrE family protein  28.32 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  29.17 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1726  hypothetical protein  28.83 
 
 		 114 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  24.58 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  31.4 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  29.17 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  33.68 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4027  iron-sulfur binding domain-containing protein  25.78 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  25.21 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2124  hypothetical protein  29.17 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3939  DsrE family protein  28.32 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  33.73 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1925  sulfur transfer complex subunit TusD  30.34 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  26.5 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3762  sulfur transfer complex subunit TusD  25.95 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000491404  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03147  hypothetical protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000155048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3541  sulfur transfer complex subunit TusD  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.84382e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3814  sulfur transfer complex subunit TusD  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03196  hypothetical protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000210262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  26.47 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3721  sulfur transfer complex subunit TusD  29.03 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000063016  normal  0.0742653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  26.17 
 
 		 116 aa  40  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.73 
 
 		 130 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3719  sulfur transfer complex subunit TusD  26.88 
 
 		 128 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3626  sulfur transfer complex subunit TusD  26.88 
 
 		 128 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000441818  hitchhiker  0.000993351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>