47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3939 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3939  DsrE family protein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  38.21 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  34.09 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  34.65 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  33.04 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1814  DsrE family protein  32.54 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000375732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1760  DsrE family protein  32.54 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000400151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  30.71 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  30.25 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  28.21 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.65 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  30.97 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  31.71 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  30.36 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  29.84 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3985  iron-sulfur binding domain-containing protein  32.04 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  29.66 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4027  iron-sulfur binding domain-containing protein  32.04 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  29.2 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  28.07 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.08 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1103  DsrE family protein  27.05 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.520397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  26.61 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  28.32 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  28.23 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2206  DsrE family protein  28.95 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  29.27 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  28.69 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  31.43 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  31.43 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  24.6 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  26.56 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  28.45 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000786463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  23.81 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  26.56 
 
 		 117 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>