57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3662 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  89.08 
 
 
119 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  89.08 
 
 
119 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  89.08 
 
 
119 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  88.24 
 
 
119 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  87.39 
 
 
119 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  87.39 
 
 
119 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  87.39 
 
 
119 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  83.19 
 
 
119 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  69.75 
 
 
119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  56.41 
 
 
117 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  53.85 
 
 
117 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  53.85 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  53.85 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  51.28 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  51.28 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  51.28 
 
 
117 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1129  DsrE family protein  51.28 
 
 
117 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000155776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4238  DsrE family protein  44.44 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.7809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3843  DsrE family protein  49.15 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  39.82 
 
 
117 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  50 
 
 
117 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  39.66 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3261  DsrE family protein  41.74 
 
 
116 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3936  DsrE-like protein  35.4 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  32.48 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  31.9 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  33.33 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  32.71 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1894  DsrE family protein  33.33 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  30.89 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  31.15 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  30.89 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  33.61 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1103  DsrE family protein  30.51 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.520397  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2206  DsrE family protein  31.09 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1814  DsrE family protein  25.42 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000375732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1760  DsrE family protein  25.42 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000400151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  23.93 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  32.1 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  32.91 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  29.84 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  29.46 
 
 
126 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3939  DsrE family protein  24.6 
 
 
123 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  27.85 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  27.03 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>