54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1725 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  258  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  60.8 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  40.62 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3939  DsrE family protein  34.09 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  31.97 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  31.97 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  31.15 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  31.15 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  30.95 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  27.87 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  30.95 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  31.5 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  30.16 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  30.71 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.95 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  30.95 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  29.37 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  29.37 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  29.17 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  31.45 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  31.54 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  32.17 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  31.01 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  26.19 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  30.23 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  26.19 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  30.23 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  29.03 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  26.19 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  26.19 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  26.19 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  30.23 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  29.84 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  26.77 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0868  hypothetical protein  26.77 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3843  DsrE family protein  28.57 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00060  sulfur transfer complex subunit TusD  30.08 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  29.46 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  26.19 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  29.13 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  29.13 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  25.41 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000786463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  28.68 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  28.68 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  28.68 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  28.68 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>