51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3843 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3843  DsrE family protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4238  DsrE family protein  71.19 
 
 		 118 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.7809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  54.7 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  52.99 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  52.14 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  52.14 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  49.57 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  49.57 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  49.57 
 
 		 117 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1129  DsrE family protein  51.28 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000155776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  43.1 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  48.31 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  49.15 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  47.46 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  47.46 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  47.46 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  48.31 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  48.31 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  48.31 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  48.31 
 
 		 119 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  45.38 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1821  DsrE-like protein  42.74 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  41.03 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  39.83 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3261  DsrE family protein  41.38 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3936  DsrE-like protein  37.07 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  36.52 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  37.07 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  35.65 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  36.52 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  36.52 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2206  DsrE family protein  36.97 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  37.61 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1103  DsrE family protein  34.75 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.520397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1894  DsrE family protein  32.2 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  29.47 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  31.36 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  26.09 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  27.87 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>