16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4455 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4455  DsrE family protein  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2124  hypothetical protein  46.02 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0167  DsrE family protein  38.1 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0541561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0873  hypothetical protein  38.68 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.247844  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  33.91 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1111  DsrE family protein  39.66 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.56014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  31.3 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3126  DsrE family protein  28.93 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0781099  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  30.7 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  32.46 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  28.07 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  29.82 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  35.29 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  30.77 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  29.41 
 
 
117 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  31.63 
 
 
118 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>