28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0963 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0963  DsrE family protein  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  32.74 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  30.17 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  30.17 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  27.5 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  28.32 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  29.66 
 
 
122 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  26.72 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  29.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0434  DsrE-like protein  28.57 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1726  hypothetical protein  27.87 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  29.66 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1291  hypothetical protein  24.14 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0625  DsrE family protein  26.72 
 
 
118 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2602  sulfur relay protein TusC  25.41 
 
 
119 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  30 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  25.42 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0314  sulfur relay protein TusC  28.91 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000155532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30390  sulfur relay protein TusC  25.41 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  26.27 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000109278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3599  sulfur relay protein TusC  22.95 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2378  sulfur relay protein TusC  25.41 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.643649  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0396  sulfur relay protein TusC  26.77 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00209341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  22.31 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4553  sulfur relay protein TusC  27.56 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3761  sulfur relay protein TusC  25.22 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000807617  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  22.88 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28130  sulfur relay protein TusC  22.95 
 
 
119 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>