30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2605 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  100 
 
 
122 aa  249  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  59.84 
 
 
122 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  28.81 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  32.2 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  40.18 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  26.67 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  35.59 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  32.41 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  32.41 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  31.48 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  30.56 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  32.48 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  30.51 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0827  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  31.62 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  28.45 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  31.4 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.18 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  28.43 
 
 
272 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  26.45 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  26.42 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1287  DsrE family protein  24.79 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.517646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  33.04 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  31.48 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  25.64 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3852  hypothetical protein  28.23 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000776129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.84 
 
 
817 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  25.89 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>