38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0884 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  44.17 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3594  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721158  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0698  DsrE family protein  40 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1263  hypothetical protein  39.83 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.597675  normal  0.0357091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  42 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  27.97 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  30.83 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  29.06 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  30.56 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  29.25 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  34.43 
 
 		 192 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  30.91 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  28.81 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  31.03 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  28.81 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  31.31 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  27.97 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  30.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  27.97 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  31.31 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  27.73 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  26.42 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30.28 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  29.82 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  28.32 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0027  DsrE-like protein  27.88 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0971578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0021  hypothetical protein  27.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  0.0439162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  29.2 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  32.04 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  25.64 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  29.2 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  25.86 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  28.69 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>