15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0441 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  228  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  44.83 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  46.55 
 
 
118 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  43.59 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  42.37 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  46.15 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  45.76 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  40.68 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  42.98 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  38.98 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  38.79 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  38.98 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  27.59 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  26.05 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  32.71 
 
 
192 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>