More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0133 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl648  CTP synthetase  73.07 
 
 
532 aa  819    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0133  CTP synthetase  100 
 
 
532 aa  1090    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.6 
 
 
531 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.79 
 
 
531 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.41 
 
 
533 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  55.01 
 
 
542 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  55.47 
 
 
533 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.28 
 
 
535 aa  615  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  52.91 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  52.72 
 
 
535 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.28 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.12 
 
 
541 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  53.85 
 
 
534 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.1 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  54.24 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  55.11 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  55.11 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  53.48 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  52.92 
 
 
540 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  53.4 
 
 
540 aa  598  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  53.64 
 
 
536 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  52.08 
 
 
542 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.12 
 
 
534 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  52.85 
 
 
537 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  50.94 
 
 
534 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  53.4 
 
 
536 aa  585  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  51.61 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  50.85 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  50.66 
 
 
534 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  52.17 
 
 
533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  51.12 
 
 
534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  50.66 
 
 
547 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  52.08 
 
 
532 aa  580  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  52.27 
 
 
557 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  52.35 
 
 
537 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  51.32 
 
 
530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  52.63 
 
 
544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  53.5 
 
 
547 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  51.78 
 
 
535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  50 
 
 
558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  50 
 
 
546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  50 
 
 
538 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  51.32 
 
 
535 aa  568  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  50.47 
 
 
545 aa  571  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  51.42 
 
 
533 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.23 
 
 
534 aa  567  1e-160  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.52 
 
 
555 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  50.56 
 
 
535 aa  566  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  49.06 
 
 
535 aa  568  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  53.4 
 
 
531 aa  565  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  50.85 
 
 
536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  51.31 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  49.25 
 
 
545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  48.39 
 
 
551 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  49.53 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.11 
 
 
534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  51.85 
 
 
549 aa  559  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.19 
 
 
559 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  50.28 
 
 
536 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  50.66 
 
 
536 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.61 
 
 
533 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  50.18 
 
 
547 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  48.96 
 
 
549 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  49.44 
 
 
542 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  48.89 
 
 
540 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  49.44 
 
 
542 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  49.72 
 
 
555 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  49.91 
 
 
555 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  49.72 
 
 
555 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  52.61 
 
 
533 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  51.98 
 
 
544 aa  551  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  49.17 
 
 
543 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  49.34 
 
 
558 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  50.28 
 
 
558 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  48.13 
 
 
535 aa  552  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  49.91 
 
 
560 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  52.8 
 
 
533 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  50.09 
 
 
542 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  50 
 
 
546 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  51.02 
 
 
555 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  49.91 
 
 
536 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  50.09 
 
 
542 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  48.39 
 
 
554 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  48.39 
 
 
549 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  49.72 
 
 
543 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  49.81 
 
 
536 aa  548  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  50.47 
 
 
559 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  48.79 
 
 
533 aa  549  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  50.47 
 
 
549 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  50.09 
 
 
542 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  49.72 
 
 
542 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>