More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0123 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  71.48 
 
 
512 aa  766    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
512 aa  1049    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 
517 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
530 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  42.33 
 
 
517 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  42.24 
 
 
517 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  42.14 
 
 
517 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 
518 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  41.52 
 
 
518 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
517 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 
517 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
517 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
517 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  42.47 
 
 
517 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 
517 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  42.19 
 
 
517 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  41.33 
 
 
518 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
513 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  43.47 
 
 
518 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  42.77 
 
 
518 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
515 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  41.25 
 
 
512 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 
515 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  41.52 
 
 
518 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.68 
 
 
514 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
514 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  42.35 
 
 
510 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
514 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
514 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  41.68 
 
 
514 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  37.57 
 
 
518 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  37.55 
 
 
519 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  38.79 
 
 
517 aa  368  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  37.38 
 
 
513 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  37.13 
 
 
523 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  39.18 
 
 
515 aa  362  9e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  41.68 
 
 
514 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 
514 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 
514 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  35.67 
 
 
523 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  36.81 
 
 
510 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.33 
 
 
645 aa  306  6e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 
659 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 
636 aa  299  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.55 
 
 
643 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
641 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  36.02 
 
 
639 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
644 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  34.77 
 
 
644 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
662 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
658 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
640 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 
659 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
658 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 
658 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.42 
 
 
644 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
658 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.98 
 
 
658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  32.51 
 
 
638 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.01 
 
 
636 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.7 
 
 
639 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.56 
 
 
642 aa  276  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.56 
 
 
642 aa  276  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.4 
 
 
635 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.33 
 
 
630 aa  273  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.64 
 
 
549 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  31.13 
 
 
640 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  32.36 
 
 
548 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  32.36 
 
 
548 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  32.36 
 
 
548 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  33.06 
 
 
641 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  33.73 
 
 
657 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.36 
 
 
560 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.73 
 
 
666 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
637 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
637 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 
544 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.52 
 
 
668 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.43 
 
 
543 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.52 
 
 
690 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  31.5 
 
 
625 aa  263  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.45 
 
 
637 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  30.43 
 
 
643 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 
545 aa  262  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  32.63 
 
 
692 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 
637 aa  262  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  31.66 
 
 
645 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.36 
 
 
543 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.93 
 
 
646 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.26 
 
 
542 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 
644 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.15 
 
 
540 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
632 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.96 
 
 
540 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  32.76 
 
 
544 aa  259  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>