30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2834 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  48.3 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  54.33 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  55.33 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  54.92 
 
 		 249 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  44.76 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  39.09 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  33.74 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  32.17 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  35.32 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  36.07 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  32.44 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.94 
 
 		 249 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  32.09 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  29.72 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  27.35 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  31.25 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25.68 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  29.5 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  30.85 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  38 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  24.49 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  29.32 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  24.62 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  25.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  25.25 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  23.53 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  26.46 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>