226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2316 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  257  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  67.46 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  67.46 
 
 		 126 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  71.43 
 
 		 126 aa  176  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  68.25 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  65.87 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  64.52 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  68.25 
 
 		 126 aa  170  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  65.87 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  69.05 
 
 		 126 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0887  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000407278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  61.9 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2041  aspartate 1-decarboxylase  67.46 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  59.52 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  60.48 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  59.68 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  59.52 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  57.6 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  59.52 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2688  aspartate 1-decarboxylase  62.71 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40119  normal  0.0325759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3089  aspartate 1-decarboxylase  62.71 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  54.4 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  54.4 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  52.42 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  54.76 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  56.45 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  54.76 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  53.97 
 
 		 126 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  51.56 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  50.42 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1864  aspartate 1-decarboxylase  51.26 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1838  aspartate 1-decarboxylase  51.26 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  52.14 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  47.01 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  51.69 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  54.13 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  46.83 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  47.2 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  48 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>