44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0221 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.78 
 
 		 532 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  44.83 
 
 		 528 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  49.38 
 
 		 539 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  53.74 
 
 		 520 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  45.5 
 
 		 539 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  48.72 
 
 		 539 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  42.95 
 
 		 526 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  48.05 
 
 		 517 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  47.31 
 
 		 567 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  45.58 
 
 		 524 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  46.34 
 
 		 527 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  44 
 
 		 513 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.34 
 
 		 518 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  48.3 
 
 		 520 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  44.51 
 
 		 527 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  44.13 
 
 		 523 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  43.79 
 
 		 516 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  46.79 
 
 		 519 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  48.32 
 
 		 519 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  42.69 
 
 		 522 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  42.18 
 
 		 526 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  46.67 
 
 		 520 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  45.58 
 
 		 523 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  44.22 
 
 		 483 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  44.22 
 
 		 520 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  40.69 
 
 		 514 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  42.86 
 
 		 573 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  42.86 
 
 		 547 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  42.86 
 
 		 541 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  38.07 
 
 		 546 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  36.22 
 
 		 559 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  26.49 
 
 		 679 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  24.49 
 
 		 670 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  30.17 
 
 		 588 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  31.36 
 
 		 583 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  31.03 
 
 		 588 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  30.17 
 
 		 588 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  30.17 
 
 		 588 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  29.36 
 
 		 588 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  30.43 
 
 		 588 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  27.7 
 
 		 392 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.17 
 
 		 585 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  25.23 
 
 		 557 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>