More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03340 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 468 aa  954    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  30.21 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  30.97 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 477 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  30.75 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  32.97 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  30.5 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 476 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 488 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  35.69 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  34.43 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 463 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  32.68 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 449 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  34.31 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  35.97 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 487 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  26.92 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  27.18 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 419 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.87 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 419 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.11 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  31.41 
 
 		 499 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  35.57 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.56 
 
 		 518 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>