28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01295 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  100 
 
 		 385 aa  787    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  24.38 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.34 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  22.19 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.19 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  22.46 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.26 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  22.85 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  33.04 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  27.45 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  23.57 
 
 		 431 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  22.93 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  25 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  20.7 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  28.85 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>