43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01144 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  882    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  29.84 
 
 		 513 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  29.84 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  30.09 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  31.21 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  31 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  31.71 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  29.73 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  29.13 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  28.47 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  28.87 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  22.45 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  24.75 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  24.07 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  24.15 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  24.15 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  23.73 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  27 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  23.81 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  23.81 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  22.74 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  22.74 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  22.74 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  22.74 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  23.37 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  23.37 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  23.37 
 
 		 564 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  23.37 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  22.74 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  22.52 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  24.01 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  30.46 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  24.01 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  24.22 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  24.42 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  23.05 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  21.74 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  23.93 
 
 		 530 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  23.71 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  23.73 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  22.6 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  21 
 
 		 580 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>