More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00854 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  100 
 
 		 435 aa  904    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  61.92 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  52.97 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  53.54 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  44.3 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  42.49 
 
 		 405 aa  347  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  42.86 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  40.86 
 
 		 409 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  41.97 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  41.71 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  41.86 
 
 		 420 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  39.64 
 
 		 412 aa  328  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  40.51 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  40.1 
 
 		 405 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  38.4 
 
 		 404 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  39.38 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  38.1 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  37.05 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  37.14 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  38.36 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  38.36 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  36.15 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  39.56 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  36.88 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  34.55 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  35.54 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  34.21 
 
 		 380 aa  246  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  33.33 
 
 		 377 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  32.96 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.28 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  31.89 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  31.23 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  30.19 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  30.19 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.92 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.92 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.92 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.92 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.92 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.65 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  31.62 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.65 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  28.42 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  28.96 
 
 		 371 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  29.97 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  30.16 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.65 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  30.05 
 
 		 373 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.14 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.14 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  30.25 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  28.18 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.53 
 
 		 357 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  30.45 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  29.41 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.37 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.46 
 
 		 354 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  29.36 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  29.13 
 
 		 358 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  28.99 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  31.55 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.99 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  29.83 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.17 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  29.54 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  31.36 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  32.38 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  28.69 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  29.91 
 
 		 384 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  31.41 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.6 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  28.31 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.01 
 
 		 384 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  29.16 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  29.62 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  31.09 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.28 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  31.09 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  29.79 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  30.67 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  29.79 
 
 		 353 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  29.23 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  30.45 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  29.79 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  28.99 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  29.43 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  27.87 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  28.97 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.77 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.43 
 
 		 353 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  28.91 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  27.45 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.46 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.02 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.02 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>