More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0441 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0441  integrase catalytic subunit  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1339  integrase catalytic subunit  46.22 
 
 
283 aa  215  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1070  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 
283 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00450828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1656  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 
223 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  35.11 
 
 
289 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  35.11 
 
 
289 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  35.11 
 
 
289 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  34.22 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  31.53 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  31.53 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  35.47 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2079  transposase  32.94 
 
 
270 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0430  transposase  32.94 
 
 
270 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  32.03 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0553  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000171843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4045  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1784  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3205  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5175  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0737  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1689  transposase  31.6 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  30.74 
 
 
294 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  30.74 
 
 
294 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  30.97 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  30.97 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  30.04 
 
 
270 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  30.04 
 
 
270 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
270 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  28.57 
 
 
522 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.56 
 
 
239 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.56 
 
 
239 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.56 
 
 
239 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.56 
 
 
239 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
390 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
390 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
390 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
393 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  31.03 
 
 
295 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  31.03 
 
 
295 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  31.03 
 
 
295 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  31.03 
 
 
295 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  29.46 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
346 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  29.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  29.26 
 
 
283 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  29.26 
 
 
283 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1515  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1904  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2026  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>