46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4002 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  54.4 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  42.47 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  42.35 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  40.11 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  38.33 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  45.18 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  39.29 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  42.55 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  42.33 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  42.67 
 
 		 203 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  42 
 
 		 291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.99 
 
 		 276 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  37.13 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  40 
 
 		 256 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  39.35 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  39.61 
 
 		 256 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.84 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  34.86 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  39.66 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  35.5 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  35.86 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  36.26 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  34.29 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  33.73 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  33.14 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  33.73 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  33.73 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.24 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  34.44 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  34.44 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  34.3 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  37.04 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  28.81 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  27.67 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  28.65 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  27.54 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>