17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2201 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  933    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  51.85 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  42.44 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  37.37 
 
 		 825 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  34.62 
 
 		 836 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  38.99 
 
 		 841 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  32.48 
 
 		 743 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  31.96 
 
 		 743 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  29.98 
 
 		 743 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  32.48 
 
 		 755 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  28.05 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  30.71 
 
 		 744 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  28.76 
 
 		 720 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  27.82 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  27.93 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  27.93 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  28.85 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>