287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0189 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  487  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  72.4 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  67.2 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  66.4 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  66.13 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  64 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  63.6 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  63.2 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  64.26 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  65.6 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  53.6 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  53.6 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  53.2 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  56.96 
 
 		 252 aa  231  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  50.2 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  49.4 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  49 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  56.96 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  51.41 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  48.59 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  52.5 
 
 		 259 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  46.99 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  40.73 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  44.96 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  40.59 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  49.2 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  44.05 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  44.07 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.66 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  47.76 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  36.03 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  48.39 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  41.4 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  37.35 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.71 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.71 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.45 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  39.32 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  39.32 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  43.46 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  37.6 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.75 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.2 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.44 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.32 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  36.32 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  37.24 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  45.75 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  35.39 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  45.8 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  35.8 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  36.91 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  37.66 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34.4 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  37.87 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  32.79 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  46.05 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  36.91 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  38.08 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  36.51 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  35.93 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.82 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.82 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  36.71 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  41.15 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  34.96 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  34.87 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  38.81 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  38.81 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  38.81 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  38.25 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  34.96 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  36.8 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  35.56 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  37.15 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  35.57 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  35.57 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  35.57 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  35.57 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  37.76 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  35.18 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  36.25 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  35.98 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  36.86 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  35.12 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>