41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1534 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1010    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0645  cell wall surface anchor family protein  28.4 
 
 
554 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  28.57 
 
 
634 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  39.68 
 
 
705 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  30.99 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  32.26 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  30.5 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  25.71 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0044  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.86 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  30.92 
 
 
901 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  26.61 
 
 
522 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  25.69 
 
 
549 aa  60.1  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  31.29 
 
 
731 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  29.39 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  38.2 
 
 
729 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  25.4 
 
 
522 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  29.95 
 
 
563 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  32.63 
 
 
4881 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  24.84 
 
 
563 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  24.52 
 
 
563 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1453  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.17 
 
 
730 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  26.5 
 
 
883 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5331  peptidoglycan binding protein  28.04 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5388  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 
564 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  34.78 
 
 
1108 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  32.5 
 
 
745 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  25.31 
 
 
1429 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0420  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
552 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.253735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.62 
 
 
475 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.24 
 
 
553 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1215  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.85 
 
 
613 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000891817 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0649  cell wall surface anchor family protein, putative  26.56 
 
 
890 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  31.21 
 
 
1066 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  29.45 
 
 
3392 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0805  hypothetical protein  28.12 
 
 
607 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1026  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
564 aa  45.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.04 
 
 
3242 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  29.91 
 
 
928 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  34.58 
 
 
3190 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  26.86 
 
 
724 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.1 
 
 
3210 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>