More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1352 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  51.78 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.09 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.08 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.76 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.08 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  31.29 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  30.26 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 275 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.07 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  31.86 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.32 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  32 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.38 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.01 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.86 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  29.73 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  26.24 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  25.25 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.6 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  27.07 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.67 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.47 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  21.54 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.47 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.94 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.26 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.51 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.18 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  26.03 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.83 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  25.53 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>