More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0780 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  953    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  56.64 
 
 
460 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  55.31 
 
 
461 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  34.89 
 
 
257 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.89 
 
 
257 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  34.89 
 
 
257 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  34.89 
 
 
257 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.17 
 
 
257 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  34.89 
 
 
257 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.17 
 
 
257 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  33.81 
 
 
257 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 
257 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 
257 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.81 
 
 
257 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  32.26 
 
 
256 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1506  hypothetical protein  41.82 
 
 
248 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.956573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  31.83 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  31.03 
 
 
261 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  31.32 
 
 
270 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0394  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 
258 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.36 
 
 
266 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  31.21 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  30.32 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.11 
 
 
267 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
277 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.87 
 
 
270 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.92 
 
 
270 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
274 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.28 
 
 
268 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.46 
 
 
270 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.67 
 
 
281 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 
258 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.32 
 
 
281 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
264 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
277 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.67 
 
 
281 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.32 
 
 
273 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
264 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  28.41 
 
 
258 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 
261 aa  100  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  25.81 
 
 
268 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  26.17 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  29.6 
 
 
258 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.97 
 
 
270 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
270 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.97 
 
 
270 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.97 
 
 
270 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 
258 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.97 
 
 
270 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.15 
 
 
258 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.97 
 
 
270 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.97 
 
 
270 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  29.62 
 
 
268 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
262 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.97 
 
 
270 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  28.04 
 
 
258 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.39 
 
 
269 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  26.28 
 
 
268 aa  97.8  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.04 
 
 
269 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.62 
 
 
466 aa  97.1  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.02 
 
 
273 aa  97.1  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.69 
 
 
268 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.87 
 
 
272 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.04 
 
 
269 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.5 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 
256 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.48 
 
 
279 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.78 
 
 
258 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  26.76 
 
 
270 aa  94.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.83 
 
 
468 aa  94  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
279 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
263 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 
258 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 
271 aa  92.8  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 
262 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.41 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  26.19 
 
 
279 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.36 
 
 
269 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 
269 aa  91.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
276 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.76 
 
 
290 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.37 
 
 
271 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1930  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
258 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.41 
 
 
290 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2077  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
258 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 
284 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 
281 aa  90.1  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 
273 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 
268 aa  89  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.41 
 
 
290 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  26.41 
 
 
319 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.69 
 
 
271 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  26.79 
 
 
290 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  27.56 
 
 
274 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3412  hypothetical protein  31.95 
 
 
142 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  25.89 
 
 
269 aa  88.2  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>