More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0537 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  100 
 
 
321 aa  639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  72.08 
 
 
308 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  67.32 
 
 
306 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  65.47 
 
 
307 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  61.11 
 
 
310 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  61.11 
 
 
310 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  59.28 
 
 
310 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  67.65 
 
 
308 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  60 
 
 
312 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.17 
 
 
312 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  60.59 
 
 
307 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  58.47 
 
 
301 aa  338  7e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  58.47 
 
 
321 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  62.99 
 
 
308 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  62.99 
 
 
308 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  60.73 
 
 
306 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  62.21 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  61.89 
 
 
307 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  56.81 
 
 
307 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  61.24 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  60.91 
 
 
307 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  60.91 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  60.91 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  60.91 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  60.91 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  61.24 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  60.59 
 
 
307 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  56.81 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  57.24 
 
 
305 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  53.82 
 
 
307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  53.18 
 
 
302 aa  305  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  60.78 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  55.08 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  55.41 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  55.74 
 
 
305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  55.41 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  53.59 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  54.79 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  55.41 
 
 
305 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.21 
 
 
308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  55.08 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  55.08 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  54.75 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  55.41 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  55.63 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  54.75 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  54.29 
 
 
317 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.7 
 
 
308 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  54.75 
 
 
305 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  55.63 
 
 
300 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  53.44 
 
 
305 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  51.32 
 
 
304 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  52.9 
 
 
311 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  52.2 
 
 
306 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  57.1 
 
 
302 aa  295  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.19 
 
 
308 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  54.75 
 
 
307 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  54.87 
 
 
311 aa  295  9e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.65 
 
 
304 aa  295  9e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.17 
 
 
310 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  53.56 
 
 
307 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.55 
 
 
317 aa  292  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  52.19 
 
 
305 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  55.16 
 
 
310 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.62 
 
 
307 aa  292  5e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  55.08 
 
 
307 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  57 
 
 
310 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.25 
 
 
308 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.05 
 
 
309 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  54 
 
 
307 aa  289  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  52.79 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  50.84 
 
 
305 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  53.92 
 
 
309 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  54.87 
 
 
309 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  50.51 
 
 
305 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  53.95 
 
 
311 aa  286  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  52.86 
 
 
305 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.19 
 
 
311 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  52.86 
 
 
305 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.6 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3608  cysteine synthase  53.97 
 
 
324 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0650049  hitchhiker  0.00838778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  51.48 
 
 
308 aa  285  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  52.6 
 
 
309 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50.68 
 
 
305 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  51.01 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  52.96 
 
 
306 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  51.8 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  52.9 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  52.43 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  52.75 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  52.73 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  48.03 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  50.34 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  54.9 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  51.46 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  53.62 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  51.69 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  54.75 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50.81 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  51.95 
 
 
324 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>