More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2158 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  100 
 
 		 327 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  43.39 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  50.35 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  42.23 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.25 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  35.58 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  37.42 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.58 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.54 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  38.41 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  41.61 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.21 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.68 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.37 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.36 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.58 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.83 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.43 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  29.32 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.32 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.64 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.24 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.39 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  33.55 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  34.66 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  27.52 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  33.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  33.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  33.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  33.55 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  33.55 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  33.55 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  33.23 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  28.95 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  33.65 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  31.49 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  33.65 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  33.33 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  33.33 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  26.81 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.12 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  33.65 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  32.14 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  28.99 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01950  1-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.960297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.89 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  27.34 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.97 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  39.07 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  33.11 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 442 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  36.69 
 
 		 442 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 449 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  37.55 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 473 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.91 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>