More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1947 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  100 
 
 		 466 aa  917    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  40.79 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  41.02 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  36.68 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  37.42 
 
 		 490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  37.28 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  37.12 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  33.92 
 
 		 451 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  32.32 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  32.68 
 
 		 487 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  36.69 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  35.43 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  32.97 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  30.86 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  30.31 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  32.33 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  28.91 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  32.69 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  30.58 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  29 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  30.39 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  26 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.06 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.17 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.55 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.06 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.61 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  27.09 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.18 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.98 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  22.37 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  26.28 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  21.95 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  24.57 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.21 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2138  amidohydrolase  27.56 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.75 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.79 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.71 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  28.28 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.71 
 
 		 451 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  24.89 
 
 		 426 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.13 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  24.65 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.81 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  25.06 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  22.14 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.17 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.88 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.32 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  22.75 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.12 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  25.95 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  27.55 
 
 		 476 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  24.7 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  26.83 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.83 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.18 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  26.69 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  25.93 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3843  amidohydrolase  26.9 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  25.44 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0675  amidohydrolase  27.88 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0433934  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  26.23 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  25.58 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.44 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  23.02 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  27.48 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  25.39 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  23.15 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  24.94 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.79 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.5 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  26.58 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  26.32 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.83 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.83 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.89 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  25.8 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.83 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  26.85 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  25.71 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.12 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.35 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  20.82 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.3 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  22.01 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.05 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.82 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  26.68 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.76 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  25.93 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.51 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  24.35 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.86 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  25.59 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>