More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3047 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
467 aa  932    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  53.35 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  40.89 
 
 
464 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.11 
 
 
480 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  41.24 
 
 
464 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.5 
 
 
528 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.67 
 
 
464 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.73 
 
 
478 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.25 
 
 
484 aa  289  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.83 
 
 
478 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.22 
 
 
465 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.57 
 
 
462 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.21 
 
 
554 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.71 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  40.22 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.04 
 
 
475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.78 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.89 
 
 
487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.04 
 
 
482 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  40.28 
 
 
485 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.13 
 
 
473 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.48 
 
 
493 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.69 
 
 
462 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.67 
 
 
464 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  40.72 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  39.11 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.11 
 
 
495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.71 
 
 
463 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  40.72 
 
 
478 aa  273  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  36.24 
 
 
468 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.44 
 
 
484 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.96 
 
 
481 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  37.67 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.78 
 
 
463 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  38.06 
 
 
457 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.69 
 
 
489 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.78 
 
 
463 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  38.06 
 
 
457 aa  269  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  38.06 
 
 
457 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.1 
 
 
479 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  37.5 
 
 
473 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  37.5 
 
 
473 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  37.83 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.28 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  38.53 
 
 
474 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  36.51 
 
 
459 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  36.91 
 
 
457 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  36.91 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  36.91 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  36.91 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  36.91 
 
 
457 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  36.51 
 
 
459 aa  263  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.27 
 
 
458 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  36.47 
 
 
470 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.54 
 
 
476 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.36 
 
 
473 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  36.36 
 
 
457 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.94 
 
 
472 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  40.28 
 
 
493 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.4 
 
 
470 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.65 
 
 
480 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  39.8 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  39.8 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.7 
 
 
461 aa  246  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.8 
 
 
472 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.47 
 
 
480 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.3 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.33 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.7 
 
 
482 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  37.06 
 
 
472 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.72 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.29 
 
 
507 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.99 
 
 
510 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.6 
 
 
521 aa  222  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.5 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.04 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.02 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.07 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.88 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.86 
 
 
485 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.32 
 
 
478 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.06 
 
 
505 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.75 
 
 
476 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  35.11 
 
 
476 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.14 
 
 
476 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.17 
 
 
478 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.67 
 
 
478 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1933  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.58 
 
 
499 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.287576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.65 
 
 
480 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3750  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.22 
 
 
497 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592413  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  36.52 
 
 
386 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
272 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.27 
 
 
297 aa  163  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 
276 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>