28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2442 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  35.62 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  36.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  30.29 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  35.09 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  30.47 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  35 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  30.53 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  33.64 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  35.21 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  33.68 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  46.38 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  27.03 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  44.12 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  44.12 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  44.12 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  44.12 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  42.65 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  33.75 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  34.21 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  40.91 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  26.96 
 
 		 233 aa  42  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>