81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0768 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
78 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  80.77 
 
 
74 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  84.62 
 
 
78 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  84.62 
 
 
78 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  84.51 
 
 
71 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
74 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  73.44 
 
 
77 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  64.79 
 
 
74 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  70.18 
 
 
75 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.21 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  61.97 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.62 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.62 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  56.9 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  56.9 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  55.17 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  53.23 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  53.23 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.75 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  55 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  61.29 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.69 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.83 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  34.72 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  57.97 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  38.03 
 
 
95 aa  47.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60.78 
 
 
75 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  35.9 
 
 
83 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
75 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  34.85 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  39.51 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
100 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 
81 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  35.14 
 
 
93 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 
321 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  47.5 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  32.05 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  42.37 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  40.3 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>