34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0449 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  57.22 
 
 		 192 aa  207  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  42.57 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  42.42 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  35.29 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.03 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.03 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  31.35 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  36.07 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  29.73 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.73 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.4 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.42 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.29 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  31.64 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  26.92 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  26.92 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.36 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  22.16 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.47 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  22.7 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.15 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.75 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  28.95 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.1 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.63 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.27 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.02 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.14 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.94 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  22.99 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.93 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.12 
 
 		 202 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>