44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1693 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
249 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  98.39 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  97.46 
 
 
236 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  54.03 
 
 
246 aa  277  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  46.56 
 
 
251 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 
239 aa  210  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 
234 aa  208  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  40.57 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  41.15 
 
 
248 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  33.88 
 
 
253 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  34.09 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  35.38 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  21.97 
 
 
277 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
296 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 
338 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
359 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
448 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.92 
 
 
407 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  45 
 
 
369 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  44.74 
 
 
355 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  45 
 
 
369 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  24.47 
 
 
274 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  41.54 
 
 
278 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
273 aa  42  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>