More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2192 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2192  transport system permease protein  100 
 
 
398 aa  773    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  67.74 
 
 
376 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2443  transport system permease protein  66.83 
 
 
374 aa  478  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0539  transport system permease protein  68.8 
 
 
390 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.692668  normal  0.940815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0304  transport system permease protein  59.3 
 
 
369 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0395  transport system permease protein  54.34 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
325 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.56 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  39.07 
 
 
332 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.12 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.12 
 
 
342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  39.12 
 
 
342 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  39.12 
 
 
342 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.12 
 
 
345 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.12 
 
 
345 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.12 
 
 
342 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.12 
 
 
342 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
342 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
342 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  40.75 
 
 
346 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  40.75 
 
 
346 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
338 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
338 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.77 
 
 
340 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.96 
 
 
338 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  37.54 
 
 
338 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  37.54 
 
 
338 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  37.54 
 
 
338 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
338 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  37.22 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.88 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  35.13 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.12 
 
 
337 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  35.91 
 
 
337 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  34.38 
 
 
345 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  34.44 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.73 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  41.81 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  35.57 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  34.23 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  34.44 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.36 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  33.89 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.1 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.76 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  34.44 
 
 
327 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  34.44 
 
 
327 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 
356 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  34.44 
 
 
327 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.67 
 
 
348 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.51 
 
 
380 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
327 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  38.33 
 
 
353 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.22 
 
 
350 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.33 
 
 
348 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
327 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.67 
 
 
348 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
327 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 
340 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
340 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
340 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
327 aa  170  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  36.84 
 
 
334 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  34 
 
 
340 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  35.14 
 
 
344 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  36.84 
 
 
334 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 
340 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.55 
 
 
350 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  36.84 
 
 
334 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  31.49 
 
 
340 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  31.11 
 
 
340 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.56 
 
 
338 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  37.62 
 
 
333 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35 
 
 
333 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  34 
 
 
340 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  34 
 
 
340 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  34 
 
 
340 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  34 
 
 
340 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.33 
 
 
336 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  34.07 
 
 
344 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.29 
 
 
367 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  34.88 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.64 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.45 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.13 
 
 
344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  38.1 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  38.56 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1140  transport system permease protein  37.38 
 
 
340 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  37.09 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  36.93 
 
 
376 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.93 
 
 
383 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  35.83 
 
 
452 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  34.94 
 
 
345 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  39.39 
 
 
351 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  33.76 
 
 
315 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.46 
 
 
363 aa  160  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>