More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0539 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0539  transport system permease protein  100 
 
 		 390 aa  752    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.692668  normal  0.940815 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  74.23 
 
 		 376 aa  557  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2443  transport system permease protein  78.17 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2192  transport system permease protein  64.93 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0304  transport system permease protein  62.86 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0395  transport system permease protein  60.57 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.87 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.53 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  41.33 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.53 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  41.33 
 
 		 346 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  40.5 
 
 		 342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  39.01 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  39.79 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 342 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 327 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.74 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 		 327 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 327 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  39.93 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  36.62 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  38.12 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  34.81 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  34.6 
 
 		 327 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.06 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  34.6 
 
 		 327 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.06 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 338 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.02 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40.14 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.37 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  38.91 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.24 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  36.04 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.52 
 
 		 328 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  40.28 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.97 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  37.07 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  37.21 
 
 		 333 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.3 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.46 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  35.14 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  34.59 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.41 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  35.89 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.18 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  37.12 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  37.12 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  31.04 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.24 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.38 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  33.14 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.73 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  37.15 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  40.14 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  35.99 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  34.71 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.97 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  34.71 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  34.71 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.79 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  37.63 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  39.46 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  35.64 
 
 		 337 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  35 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.42 
 
 		 678 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.42 
 
 		 678 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.1 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  32.52 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  33.53 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  34.36 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.92 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  34.92 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>