34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0082 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  100 
 
 
157 aa  316  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  71.97 
 
 
159 aa  222  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 
157 aa  174  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
145 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  33.81 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  35.4 
 
 
548 aa  48.5  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  42 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.87 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  36.26 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
191 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
161 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
146 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.86 
 
 
131 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
167 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>