290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
424 aa  867    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 
431 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  44 
 
 
433 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  32.33 
 
 
446 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.38 
 
 
730 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.56 
 
 
738 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.94 
 
 
723 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.4 
 
 
730 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  29.5 
 
 
453 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  29.41 
 
 
451 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  24.68 
 
 
380 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  23.84 
 
 
380 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  24.07 
 
 
418 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  24.16 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  23.16 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  23.97 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 
442 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  26.63 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  26.7 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  22.97 
 
 
474 aa  84  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.24 
 
 
474 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  25.75 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  25.64 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.718248 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  23.24 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.24 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
763 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.24 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  24.02 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.24 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  24.62 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  25.41 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  24.22 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
765 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  25.07 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.25 
 
 
1293 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  24.52 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  22.99 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  25 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  26.98 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  26.3 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  26.3 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  24.86 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl430  6-phospho-beta-glucosidase  26.23 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.14 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  23.85 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  23.45 
 
 
476 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  25.31 
 
 
479 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  25.51 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  25.94 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  22.69 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  23.74 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  25.51 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  25.69 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  25.25 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  22.52 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  23.76 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  25.8 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  25.25 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  23.48 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  25.77 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  22.17 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  22.75 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  22.17 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  26.65 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  22.74 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  22.17 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  22.44 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  22.74 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  24.88 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  22.03 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  24.86 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  25.44 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  22.77 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.98 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  22.35 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  23.17 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  20.91 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  24.03 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  22.35 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  24.09 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  24.32 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.74 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  22.96 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.36 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  24.81 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  24.32 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  24.4 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  24.4 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1637  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  25.63 
 
 
454 aa  69.7  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  24.4 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  26.08 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  24.4 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>