More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08950 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  54.35 
 
 		 160 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  50.35 
 
 		 160 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  51.75 
 
 		 146 aa  160  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  52.41 
 
 		 147 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  55.24 
 
 		 145 aa  159  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  48.2 
 
 		 147 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  50.36 
 
 		 152 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  51.77 
 
 		 146 aa  158  7e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  49.65 
 
 		 152 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  51.41 
 
 		 155 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  54.23 
 
 		 146 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  46.43 
 
 		 163 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  46.21 
 
 		 150 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  50.36 
 
 		 159 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  49.01 
 
 		 154 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  48.55 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 145 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  50.35 
 
 		 154 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  48.63 
 
 		 161 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  49.65 
 
 		 149 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  50.35 
 
 		 154 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.94 
 
 		 146 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.29 
 
 		 145 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  48.94 
 
 		 148 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  48.18 
 
 		 146 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  49.65 
 
 		 153 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  51.77 
 
 		 146 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.86 
 
 		 162 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  50.7 
 
 		 154 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.23 
 
 		 148 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  50.36 
 
 		 141 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  51.08 
 
 		 170 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  48.18 
 
 		 153 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  49.65 
 
 		 151 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  48.94 
 
 		 161 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.94 
 
 		 148 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  48.57 
 
 		 153 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.94 
 
 		 148 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  46 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  49.3 
 
 		 155 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  47.55 
 
 		 150 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  49.28 
 
 		 147 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  46.76 
 
 		 150 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  46.81 
 
 		 151 aa  148  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  45.89 
 
 		 153 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  49.28 
 
 		 147 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  46.15 
 
 		 154 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  46.21 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  49.28 
 
 		 147 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48.91 
 
 		 155 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  46.76 
 
 		 150 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  47.76 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  47.55 
 
 		 149 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  48.23 
 
 		 151 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  50.35 
 
 		 146 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  47.86 
 
 		 153 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  49.65 
 
 		 157 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  48.28 
 
 		 148 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  48.94 
 
 		 151 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  47.92 
 
 		 148 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  50 
 
 		 145 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  47.92 
 
 		 148 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  48.97 
 
 		 145 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  44.14 
 
 		 150 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  47.86 
 
 		 145 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  46.1 
 
 		 148 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  44.59 
 
 		 150 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.92 
 
 		 532 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  47.45 
 
 		 148 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  51.45 
 
 		 153 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  44.67 
 
 		 155 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  46.04 
 
 		 149 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  44.37 
 
 		 151 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  45.39 
 
 		 148 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  48.91 
 
 		 155 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>