34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6299 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.87 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  28.38 
 
 
636 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.92 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.15 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
597 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  28.29 
 
 
295 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  35.34 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  35.11 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
1103 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.54 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  26.91 
 
 
618 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
1103 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  26.25 
 
 
618 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  32.85 
 
 
592 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  36.36 
 
 
638 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  36.36 
 
 
638 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.68 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  33.33 
 
 
615 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  32.85 
 
 
334 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  31.68 
 
 
614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.81 
 
 
451 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  36.45 
 
 
634 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  27.43 
 
 
618 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.12 
 
 
631 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  34.68 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  31.75 
 
 
592 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  23.72 
 
 
605 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
274 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.27 
 
 
251 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>