25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5451 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  100 
 
 
338 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1057  lipase, class 2  31.2 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.24448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3530  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.78 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.21 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  29.7 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.87 
 
 
222 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.21 
 
 
217 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  30.1 
 
 
225 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3918  hypothetical protein  29.56 
 
 
595 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.949501  normal  0.0278587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  30.1 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  24.87 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  34.21 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  27.78 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  28.37 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  34.43 
 
 
2169 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  29.46 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  28.15 
 
 
311 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  23.45 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  31 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  27.74 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  26.64 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.36 
 
 
293 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  31.25 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  32.04 
 
 
377 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>