224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4990 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  816    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  34.01 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  34.01 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  34.01 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  33.83 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  33.33 
 
 		 491 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  34.88 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  33.25 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  33.92 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  33.6 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  34.84 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  34.84 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  34.84 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  34.84 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  34.84 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  34.16 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  33.49 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  33.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  31.11 
 
 		 428 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  31.51 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  31.51 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  31.51 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  29.93 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  30.05 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  31.58 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  31.32 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  33.51 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  31.11 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 473 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  31.96 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 475 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 459 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 457 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  32.32 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  30.82 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.42 
 
 		 271 aa  136  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  31.5 
 
 		 460 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  25.12 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  30.33 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  26.33 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  29.44 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  28.31 
 
 		 461 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  26.46 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  29.18 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>