181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2678 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  36.27 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  37.63 
 
 		 592 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  35.64 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  37.65 
 
 		 605 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  34.04 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  35.48 
 
 		 592 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  34.34 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  34.78 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  33.67 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  36 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.1 
 
 		 558 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  35 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  33.7 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33.7 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  31.07 
 
 		 647 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  31 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3321  ferredoxin  33.94 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  33.7 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  32 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  31.87 
 
 		 612 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  30.3 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  33.78 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  36.36 
 
 		 622 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.63 
 
 		 616 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  30.84 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  34.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  32 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  42 
 
 		 635 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.98 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  30.85 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  44.68 
 
 		 642 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  29 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  30.85 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.14 
 
 		 571 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  35.23 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  44.62 
 
 		 592 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.41 
 
 		 683 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  29.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  29.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  46.81 
 
 		 630 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1493  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  35.56 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  35.56 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  30.36 
 
 		 608 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  32 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  28.72 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  34.12 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.85 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.79 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  29.79 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.14 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  42.55 
 
 		 650 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  34.09 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  33.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  32.88 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  34.92 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  46 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.25 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 578 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.46 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>