43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0853 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  96.37 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  40.13 
 
 		 270 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  35.62 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  30.99 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  28.99 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 593 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  34.48 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  30.27 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  39.81 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  21.57 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 592 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.76 
 
 		 617 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 589 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  31.82 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 		 641 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  38 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  38 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  38 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 610 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.34 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  34.13 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 		 565 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 615 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  27.61 
 
 		 602 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 		 275 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.28 
 
 		 581 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.44 
 
 		 578 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  28.89 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  25.28 
 
 		 576 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  27.42 
 
 		 595 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  26.03 
 
 		 602 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  28.89 
 
 		 599 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 587 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.86 
 
 		 574 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  22.81 
 
 		 605 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  33.75 
 
 		 616 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 576 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>