More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0343 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0343  aminotransferase class-III  100 
 
 
444 aa  927    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0584  aminotransferase class-III  48.46 
 
 
429 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.660945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0203  aminotransferase, class III pyridoxal-phosphate dependent  45.37 
 
 
429 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0148  class III aminotransferase  36.39 
 
 
442 aa  302  9e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000391893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1045  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.1 
 
 
397 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3385  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.55 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0376  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.75 
 
 
499 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  38.69 
 
 
817 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0433  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.53 
 
 
453 aa  250  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586788  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0678  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.418297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3156  aminotransferase class-III  35.64 
 
 
430 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0601  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.72 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.931901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2388  aminotransferase class-III  30.89 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.883188  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.72 
 
 
432 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.43 
 
 
427 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2017  aminotransferase class-III  35.03 
 
 
424 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  32.48 
 
 
675 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.69 
 
 
429 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.3 
 
 
429 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.68 
 
 
451 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.4 
 
 
433 aa  203  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
427 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.22 
 
 
446 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.14 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.97 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.47 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1970  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.77 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.11 
 
 
427 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
427 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.01 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.19 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.09 
 
 
427 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.41 
 
 
426 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12310  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.83 
 
 
428 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0595101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.54 
 
 
428 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.7 
 
 
425 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.02 
 
 
427 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.99 
 
 
428 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.42 
 
 
452 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.48 
 
 
426 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.77 
 
 
432 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.86 
 
 
429 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
429 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.33 
 
 
428 aa  193  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50966  predicted protein  31.67 
 
 
468 aa  193  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.48 
 
 
427 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.75 
 
 
431 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.04 
 
 
428 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.44 
 
 
438 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.56 
 
 
427 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
427 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.87 
 
 
434 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.92 
 
 
428 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.04 
 
 
422 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.5 
 
 
435 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.16 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.19 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.4 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.77 
 
 
445 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.09 
 
 
429 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.13 
 
 
432 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
432 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.74 
 
 
428 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.46 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
428 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.52 
 
 
441 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.24 
 
 
418 aa  189  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.84 
 
 
427 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
428 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.72 
 
 
424 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.18 
 
 
431 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.37 
 
 
430 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.73 
 
 
427 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.11 
 
 
425 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3565  aminotransferase class-III  36.16 
 
 
435 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.9 
 
 
428 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.17 
 
 
430 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.94 
 
 
427 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  28.5 
 
 
682 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.5 
 
 
422 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.4 
 
 
445 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.43 
 
 
430 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.23 
 
 
430 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.71 
 
 
428 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1246  aminotransferase class-III  37.5 
 
 
427 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100805  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.51 
 
 
428 aa  187  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.77 
 
 
438 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.7 
 
 
427 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.86 
 
 
431 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.57 
 
 
432 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0936  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.33 
 
 
430 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.579841  normal  0.783597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.56 
 
 
433 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33 
 
 
433 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.47 
 
 
437 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.58 
 
 
431 aa  186  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.23 
 
 
430 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.59 
 
 
428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.23 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.23 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.16 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>