More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1375 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
334 aa  689    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  69.97 
 
 
333 aa  472  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  68.17 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.87 
 
 
333 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.76 
 
 
333 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.65 
 
 
333 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.65 
 
 
333 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.86 
 
 
339 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  62.54 
 
 
333 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.68 
 
 
335 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.88 
 
 
346 aa  388  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.62 
 
 
343 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  57.19 
 
 
343 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.55 
 
 
339 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  56.55 
 
 
339 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  56.55 
 
 
339 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.55 
 
 
339 aa  363  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  56.55 
 
 
339 aa  364  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  55.95 
 
 
339 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.25 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.25 
 
 
339 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  55.65 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  55.65 
 
 
339 aa  361  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.95 
 
 
339 aa  361  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  55.65 
 
 
339 aa  361  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  55.36 
 
 
339 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  55.36 
 
 
339 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 
339 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.98 
 
 
339 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.08 
 
 
339 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.46 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
347 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.27 
 
 
335 aa  249  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  41.38 
 
 
358 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.42 
 
 
351 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
348 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
348 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.69 
 
 
347 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.51 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.61 
 
 
348 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
348 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
351 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.88 
 
 
348 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
359 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1987  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.9 
 
 
214 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
348 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
347 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.24 
 
 
352 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.17 
 
 
346 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.76 
 
 
350 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  40.35 
 
 
353 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
352 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
350 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
348 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 
348 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
350 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
349 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
348 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.3 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.06 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.87 
 
 
350 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
350 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.79 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
350 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
353 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02940  alcohol dehydrogenase (NADP+), putative  38.97 
 
 
367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.013941  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  39.7 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.98 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.38 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.36 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.43 
 
 
351 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.06 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.58 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.42 
 
 
358 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.5 
 
 
348 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
348 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
353 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
354 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.98 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.98 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.98 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.98 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.69 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.98 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.51 
 
 
347 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.42 
 
 
350 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
350 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
350 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
350 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
350 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
350 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
350 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
352 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
347 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>