18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3133 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1211    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3004  hypothetical protein  54.08 
 
 
295 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  38.36 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  32.42 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.42 
 
 
838 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  29.14 
 
 
433 aa  63.9  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.32 
 
 
1931 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  27.72 
 
 
724 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.54 
 
 
1035 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.67 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  31.48 
 
 
810 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  27.39 
 
 
1056 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  32.54 
 
 
749 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.32 
 
 
230 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  30.71 
 
 
954 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  27.74 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  25.69 
 
 
471 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>