More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1847 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1847  carbonic anhydrase  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0389463  normal  0.137293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2131  carbonic anhydrase  47.03 
 
 
247 aa  195  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.575311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0648  carbonic anhydrase  46.69 
 
 
229 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0295  carbonic anhydrase  50 
 
 
234 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0295  carbonic anhydrase  45.54 
 
 
226 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000632225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2452  carbonic anhydrase-like protein  30.05 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  27.19 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  32.57 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352199 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  29.36 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  29.56 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  28.74 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1138  Carbonate dehydratase  29.44 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.580584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  30.48 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  34.23 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  31.75 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  29.02 
 
 
726 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  41.96 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  32.39 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0412  Carbonate dehydratase  30.56 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  31.03 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  27.23 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  31.21 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  31.84 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  31.84 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  30.34 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  31.84 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  30.34 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  26.6 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  31.84 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  31.84 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  31.47 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  31.28 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  29.06 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  30.99 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  42.5 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  27.15 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04230  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  32.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  32.42 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  41.44 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  35.65 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  31.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  44.04 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  30.46 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  30.86 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  30.34 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5585  carbonate dehydratase  30.22 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691086  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2174  carbonate dehydratase  30 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2296  carbonate dehydratase  30 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  29.96 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  31.5 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  42.35 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  32 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  30.41 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  28.95 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  36.7 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  27.91 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  25.71 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  24.64 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1646  carbonate dehydratase  30 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  30.72 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  30.54 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2257  carbonate dehydratase  30 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2281  carbonate dehydratase  31.11 
 
 
214 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.710265  normal  0.440808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  29.06 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  34.51 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  27.05 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  28.32 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  29.63 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  40.57 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  31.49 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  43.53 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  30.17 
 
 
220 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  26.89 
 
 
207 aa  52  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  31.49 
 
 
234 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  27.09 
 
 
204 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  35.78 
 
 
272 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  32.61 
 
 
235 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
218 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  23.2 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  23.92 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  29.48 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  29.48 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  40.74 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  31.93 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  34.29 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  32.61 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  34.55 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  32.61 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  23.92 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  28.49 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  29.21 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  29.21 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  23.92 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  28.85 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  33.52 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  28.21 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>